Philibert Berthelier sera exécuté devant le château de l’Ile le 23 août 1519. Le bourreau traînera ensuite son cadavre et le pendra au gibet de Champel, tandis que sa tête sera exposée à Plainpalais.

Deux de ses fils seront des fervents opposants à Jean Calvin. Condamnés à mort, l’un parviendra à fuir. L’autre sera décapité en 1557.